脸部扁平疣有很多方法去除，常用的有以下几种：
1、涂抹药膏。如果脸上只有一两个扁平疣，那么就可以考虑在扁平疣上涂抹一点咪喹莫特软膏、5-氟尿嘧啶软膏、阿昔洛韦乳膏或酞丁胺涂剂，这样就能逐渐根除脸上的扁平疣了。不过，如果、对这些外用药过敏，那么就只能涂抹调制好的中药液来治疗扁平疣。
2、物理治疗。目前，临床中主要使用冷冻和激光这两种物理疗法来治疗扁平疣，只需经过几次的专业治疗，就能彻底消除脸上的扁平疣。不过，在治疗前后，需要详细的了解治疗前后的注意事项，这样才能避免出现治疗不彻底的情况。
3、口服药物。在治疗面部扁平疣时，既可以服用左旋噗唑药片等具有抗病毒功效的西药，也可以服用由薏苡仁，苍术，马齿苋，陈皮，红花，藿香，甘草，厚朴和白术等中草药熬制成的药液。不管选择哪类药物，都能达到根除扁平疣的目的。
4、激光治疗。激光手术主要是通过脉冲光治疗，可以将皮肤上凸起的细胞组织去除，让皮肤变得平整和光滑，从而去除扁平疣